A mecanobiologia investiga o papel das forças físicas no desenvolvimento de embriões. Vou apresentar meu trabalho sobre como o sulco que divide a cabeça do tronco no embrião de drosófilas pode ter um importante papel mecânico para a gastrulação. O congresso Mecanobiologia no desenvolvimento e na doença está sendo no EMBL de Heidelberg.
Época de reprodução tem o ano inteiro… começando o mês dos braquiópodos. O tempo está bom pra sair com o barco.
Meio de setembro! Começou a temporada do basquete e ganhamos o primeiro jogo na terceira divisão na prorrogação.
Fim-de-semana passado teve o festival de cerveja de Bergen (Ølfestival). Você paga uma mini tulipa e tickets e vai tirando chops das micro e macro cervejarias!
Alguns dias antes saímos para coletar uns bichos com o barco da universidade.
Finalmente antes disso fiz um mini curso do doutorado numa micro ex-cidade pesqueira chamada Glesvær. Saímos de barco e pescamos a janta.
Nada muito diferente acontecendo por aqui. A comissão de segurança decidiu que é obrigatório usar jalecos nos laboratórios, independente do que estivermos fazendo. Medida polêmica, mas inócua comparada aos planos da “eficiente” comissão que inviabilizaria a pesquisa de todos os laboratórios do Sars. Mas enfim.
Semana passada a irmã do Chema veio visitar com o marido e trouxeram quitutes espanhóis como queijo, vinho, morcilla e chorizo. Muito bom!
Em fevereiro fomos coletar os priapúlidos na Suécia de novo. Teve vento, gelo e frio. Acabamos de mãos vazias, mas a viagem rendeu estes dois emocionantes trailers:
Saída pra coletar braquiópodos e nemertodermatídeos rendeu picnogônidos gigantes, nemertinos coloridos e até submarino!
Hoje completam seis meses que cheguei aqui. Passou rápido, mas também foram bem intensos. Estou gostando bastante do laboratório, era exatamente o que queria: embriões, larvas e evolução de invertebrados marinhos. Meu projeto é estudar alguns processos do desenvolvimento em larvas marinhas diferentes e compará-los. Além de estudar as formas, que foi o que fiz com as bolachas, estou olhando a expressão de genes. Aprendi o básico do molecular e confesso que estou gostando, mas ainda falta ficar “fluente” em várias coisas.
É tudo muito engenhoso… primeiro eu preciso descobrir os genes que um organismo tem. Pra isso coletamos amostras de tecido ou embriões/larvas, extraímos o DNA/RNA e enviamos este material bruto para ser sequenciado, ou seja, uma máquina vai ler a informação, organizar e passar para o computador. Com estas sequências posso checar se o organismo tem determinado gene; faço isso comparando com genes já descritos de outras espécies. Bam, encontrei o gene que queria. Mas meu objetivo é descobrir onde este gene está ativo nos embriões, é no olho, na boca, no ânus, na barriga? Para isso eu primeiro preciso de uma boa quantidade de cópias do gene para conseguir trabalhar. Começo construindo duas curtas sequências que são complementares com a sequência do gene. Coloco o DNA, as sequências e uma enzima num tubinho numa máquina. Essas sequências vão grudar uma em cada canto do gene e tudo que estiver entre elas vai ser replicado. Isso acontece exponencialmente e em menos de 3h eu tenho zilhões de cópias do meu gene no tubinho.
Essas cópias degradam com o tempo, por isso faço uma reação que vai inserir cada cópia em um DNA circular, que é muito mais estável. Mas ainda não sei se o que inseri no DNA circular é a cópia do meu gene original. Por isso, misturo este DNA com bactérias e dou um choque térmico nelas, que no susto incorporam o DNA circular. Deixo as bactérias crescendo e vejo as bactérias que consequiram incorporar o DNA circular; pego essas e deixo elas se multiplicarem a vontade, pois assim estarão fazendo mais cópias. Por fim, explodo as bactérias para deixar apenas o DNA circular, faço mais um round de replicação e mando essas amostras para sequenciar para saber se as cópias que tenho são mesmo do meu gene ou se alguma outra coisa foi replicada por engano.
Chega a hora de usar o gene que “clonei” acima para criar uma sonda. Basicamente é pegar a sequência e criar uma sequencia complementar que ao entrar em contato com o embrião, vai grudar onde o gene original estiver ativo. Só é preciso grudar um anticorpo na sonda para que consigamos ver aonde foi que a hibridização ocorreu. E com isso sabemos onde os genes estão sendo expressos e podemos inferir o papel deles na formação das estruturas dos embriões. No geral isso demora umas 2 semanas, só que pode não dar certo… Estou começando a ter alguns resultados (o que dá um ânimo extra), mas algumas coisas ainda não estão funcionando (e ainda não sei pq). Mas também é meio inevitável quando você trabalha com organismos que pouca gente estuda.
Com isso vocês podem ter uma idéia melhor do que é o trabalho, apesar de que só expliquei as moléculas… Acho que 6 meses não cabem num post só, vou tentar escrever o próximo logo.
