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Converter vídeo para GIF animado

Algo que comecei a fazer com mais freqüência é converter vídeos de embriões se desenvolvendo ou de animais marinhos para GIFs animados. Mas como fazer a conversão sem perder a qualidade? Bastante tempo atrás encontrei este guia para converter vídeos em GIFs animados de alta qualidade usando a ferramenta FFmpeg. O truque é gerar uma […]

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Buscar artigos da PLOS pelo DuckDuckGo

Ano passado resolvi experimentar a DuckDuckHack, plataforma de desenvolvimento para o buscador DuckDuckGo. A idéia era usar as respostas instantâneas, característica do pato, para encontrar artigos científicos; ou seja, um Google Scholar alternativo. Apesar de parecer possível, resolvi tentar algo mais simples. Um plugin que usa o API da PLOS para buscar artigos (como esse) […]

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Cifonauta, um banco de imagens para a biologia marinha

O Cifonauta foi inaugurado no dia 26 de setembro do ano passado (2011) e completa hoje 1 ano de vida pública. A ideia de um banco de imagens da vida marinha, no entanto, é mais antiga. A documentação fotográfica faz parte de muitas abordagens de pesquisa e nos 30 anos de CEBIMar muito material foi […]

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Mestre em LaTeX de roupa nova

Aproveitando que algumas pessoas me mandaram suas modificações do Mestre em LaTeX nesta semana, resolvi tirar a poeira de lá. Migrei o desenvolvimento para o GitHub, onde mantenho meus programas: github.com/nelas/mestre-em-latex. Agora fica mais fácil pra outras pessoas contribuirem criando um clone ou editando o wiki. O screenshot abaixo é da nova página que fica […]

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Gene Fetcher tool no Zim Desktop Wiki

Tenho usado o Zim Desktop Wiki como caderno de anotações faz algum tempo. Ele salva as notas como arquivo texto com marcação wiki permitindo que eu acesse o conteúdo diretamente com outros editores e facilitando o backup (eg, pasta de notas sincronizada no Dropbox). Comecei a mexer com genes no doutorado e estava guardando as […]

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Bibliografia Viva

O Bibliografia Viva nasceu quando, algumas semanas atrás num sábado de manhã, eu caí de paraquedas (online) no Hack4Knowledge, um encontro para criar aplicativos, ferramentas e remisturas que aproveitem os bancos de dados existentes para inovar e enriquecer a criação e disseminação do conhecimento. Eu já estava fazendo uns testes com o API do Mendeley […]

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Mogrify

Pequeno shell script com o mogrify que uso bastante para redimensionar e adicionar marca d’água em várias imagens (jpg, no caso) numa tacada só. Faz backup dos originais em uma nova pasta, redimensiona imagens com largura maior que 640px e insere marca com transparência de 20% no topo esquerdo. As aspas servem para evitar erros […]

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Lagoa Multiphysics

Nossa, achei muito foda. Quero usar pra fazer embriões virtuais!

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The package needs to be reinstalled

Outro dia o apt-get falhou na hora de atualizar um pacote vindo de um ppa (gwibber-daily, no caso). The package needs to be reinstalled, but I can’t find an archive for it. Resultado: não conseguia reinstalar o pacote nem removê-lo. Hoje encontrei a solução: via superuser Só pra compartilhar e achar fácil quando acontecer de novo…

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Mestre em LaTeX v0.2

Acabo de lançar uma nova versão do Mestre em LaTeX! Fiz uma boa limpeza no código e corrigi os poucos (mas importantes) bugs que haviam sido reportados. As principais mudanças foram a melhoria da formatação dos elementos pré-textuais (capa até sumário), o ajuste para que seções comecem sempre nas páginas ímpares e re-estruturação do texto. […]