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Site da exposição Oceano atualizado

O site da exposição Oceano: vida escondida foi um dos primeiros que fiz, lá em meados de 2007. Ele mostra imagens de organismos marinhos com rara beleza estética. É a versão online de uma exposição itinerante que rolou no mundo real daquela época (teve até reportagem e bastidores). Outro dia, revisei o conteúdo e apenas […]

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Projeto para modernização do Cifonauta aprovado

Nossa proposta “Ampliação e Modernização do Banco de Imagens de Biologia Marinha — Cifonauta” submetida para o “Edital de Preservação e Curadoria de Acervos e Patrimônio Cultural da Universidade de São Paulo” da Pró-Reitoria de Cultura e Extensão Universitária (PRCEU 02/2022) foi aprovado! O Cifonauta, um banco de imagens para a biologia marinha, foi inaugurado […]

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Converter vídeo para GIF animado

Algo que comecei a fazer com mais frequência é converter vídeos de embriões se desenvolvendo ou de animais marinhos para GIFs animados. Mas como fazer a conversão sem perder a qualidade? Bastante tempo atrás encontrei este guia para converter vídeos em GIFs animados de alta qualidade usando a ferramenta FFmpeg. O truque é gerar uma […]

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Buscar artigos da PLOS pelo DuckDuckGo

Ano passado resolvi experimentar a DuckDuckHack, plataforma de desenvolvimento para o buscador DuckDuckGo. A idéia era usar as respostas instantâneas, característica do pato, para encontrar artigos científicos; ou seja, um Google Scholar alternativo. Apesar de parecer possível, resolvi tentar algo mais simples. Um plugin que usa o API da PLOS para buscar artigos (como esse) […]

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Cifonauta, um banco de imagens para a biologia marinha

O Cifonauta foi inaugurado no dia 26 de setembro do ano passado (2011) e completa hoje 1 ano de vida pública. A ideia de um banco de imagens da vida marinha, no entanto, é mais antiga. A documentação fotográfica faz parte de muitas abordagens de pesquisa e nos 30 anos de CEBIMar muito material foi […]

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Mestre em LaTeX de roupa nova

Aproveitando que algumas pessoas me mandaram suas modificações do Mestre em LaTeX nesta semana, resolvi tirar a poeira de lá. Migrei o desenvolvimento para o GitHub, onde mantenho meus programas: github.com/bruvellu/mestre-em-latex. Agora fica mais fácil para outras pessoas contribuírem criando um clone ou editando o wiki. O screenshot abaixo é da nova página que fica […]

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Gene Fetcher tool no Zim Desktop Wiki

Uso o Zim Desktop Wiki como caderno de anotações faz algum tempo. Ele salva as notas como arquivo texto com marcação wiki, permitindo que eu acesse o conteúdo diretamente com outros editores e facilitando o backup (e.g., pasta de notas sincronizada no Dropbox). Comecei a mexer com genes no doutorado e estava guardando as sequências […]

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Bibliografia Viva

O Bibliografia Viva nasceu quando, algumas semanas atrás, num sábado de manhã, eu caí de paraquedas (online) no Hack4Knowledge, um encontro para criar aplicativos, ferramentas e remisturas que aproveitem os bancos de dados existentes para inovar e enriquecer a criação e disseminação do conhecimento. Eu já estava fazendo uns testes com o API do Mendeley […]

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Redimensione imagens com o mogrify

Pequeno bash script com o mogrify para redimensionar e adicionar marca d’água em várias imagens (jpg, no caso) numa tacada só. Uso bastante! O script faz backup dos originais em uma nova pasta, redimensiona imagens com largura maior que 640px e insere marca com transparência de 20% no topo esquerdo. As aspas evitam erros caso […]

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Lagoa Multiphysics

Nossa, achei muito foda. Quero usar pra fazer embriões virtuais!